ABSTRACT Understorey herbs form a diverse and understudied plant assemblage in tropical forests. Although several studies and research teams have long been dedicated to the study of this conspicuous vegetation component in Amazonia, no effort to unify the data has been undertaken to date. In contrast to trees and other life forms for which major data compilations already exist, a unified database dedicated to herbs is still lacking. Part of the problem is in defining what is a herb and how to effectively sample herb assemblages. In this article, we describe the database HERBase, an exhaustive compilation of published and unpublished data on herb inventories in Amazonia. We also describe the structure, functioning, and guidelines for data curation and integration in HERBase. We were able to compile information from 1381 plots from all six Amazonian geographic regions. Based on this dataset, we describe and discuss sampling and knowledge gaps, priority areas for new collections, and recommend sampling protocols to facilitate data integration in the future. This novel database provides a unique biodiversity data repository on understorey herbs that will enable new studies on community ecology and biogeography.

RESUMO As ervas do sub-bosque formam um componente diversificado e pouco estudado em florestas tropicais. Embora vários estudos e grupos de pesquisa tenham se dedicado ao estudo desse componente conspícuo na Amazônia, nenhum esforço foi feito até o momento para unificar essas informações. Em contraste com árvores e outros grupos de plantas para os quais já existem grandes compilações de dados, uma base de dados unificada dedicada às ervas ainda não existe. Parte do problema está em definir o que é uma erva e como amostrar comunidados de ervas de forma eficiente. Neste artigo descrevemos a base de dados HERBase, uma compilação exaustiva de dados publicados e não publicados sobre inventários de ervas na Amazônia. Também descrevemos a estrutura, funcionamento e diretrizes para curadoria e integração de dados na HERBase. Conseguimos compilar informações de 1381 parcelas de todas as seis regiões geográficas amazônicas. Com base nesses dados, descrevemos e discutimos lacunas de amostragem e conhecimento, apontamos áreas prioritárias para novas coletas e recomendamos protocolos de amostragem para facilitar a integração de dados no futuro. Essa nova base de dados fornece dados únicos de biodiversidade sobre ervas do sub-bosque que permitirão novos estudos sobre ecologia e biogeografia de comunidades.

Abstract Tropical forests have been subjected to increasing deforestation, leading to severe habitat loss and fragmentation of the landscape. Studies of various plant groups-indicate alteration in species diversity and assemblage composition in response to these impacts. How theses impacts affect ferns and lycophytes, however, is less well known. In this study we evaluate the effects of habitat loss and fragmentation on ferns and lycophytes in lowland non-inundated forests in Ecuadorian Amazonia. We obtained assemblage information from thirteen plots located in gradients of habitat loss and fragmentation (as measured by the landscape fragmentation index: fragindex) and used community and diversity indices to evaluate species responses. We found 3,824 individuals of 55 species. The plot with the highest fragindex value (more than 20% of habitat loss and fragmentation) had the lowest diversity, but the highest diversity was found in plots with fragindex values from 12% to 21% of habitat loss and fragmentation rather than in the landscapes without deforestation. Although community composition varied along the fragindex gradient, species turnover was not significantly related to this index. These results suggest that changes in the landscape caused by deforestation alter the availability of habitats, consequently affecting the distribution patterns of ferns and lycophytes.

Resumo O incremento do desmatamento em florestas tropicais tem causado uma perda severa de habitats e fragmentação da paisagem. As respostas das espécies a esses impactos antrópicos indicam alteração na diversidade e composição das comunidades de espécies e têm sido estudadas para vários grupos de plantas. Como esses impactos afetam a comunidade de samambaias e licófitas, no entanto, é menos conhecido. Neste estudo, avaliamos os efeitos da perda e fragmentação de habitat em samambaias e licófitas em florestas não inundadas de terras baixas na Amazônia equatoriana (bacia amazônica ocidental). Obtivemos informações da comunidade de treze parcelas localizadas em um gradiente de fragmentação (medido por um índice de fragmentação da paisagem: o fragindex) e usamos índices de comunidade e diversidade para avaliar as respostas das espécies. Encontramos 3.824 indivíduos de 55 espécies de samambaias e licófitas. A parcela com o maior valor de fragindex (mais de 20% de perda e fragmentação de habitat) teve a menor diversidade, mas a maior diversidade foi encontrada em parcelas com valores de fragindex entre 12% e 21% e não nas parcelas em paisagens sem desmatamento. Embora a composição da comunidade tenha variado ao longo do gradiente do fragindex, a renovação de espécies não foi significativamente relacionada a esse índice. Esses resultados sugerem que as mudanças na paisagem causadas pelo desmatamento alteram a disponibilidade de habitats, afetando consequentemente os padrões de distribuição de samambaias e licófitas.

RESUMO Uma nova espécie de samambaia espinhosa do gênero Dennstaedtia é descrita para a Amazônia brasileira e peruana. Dennstaedtia aculeata (sp. nov.) é a terceira espécie espinhosa conhecida para o gênero e a primeira na América do Sul. A comparamos com outra Dennstaedtia espinhosa da região neotropical, D. spinosa. Também apresentamos imagens, ilustrações e um mapa de distribuição dos espécimes, e discutimos a preferência da espécie por habitats de solos ricos ou relativamente ricos em nutrientes e a espinescência na família.

ABSTRACT A new spiny fern belonging to the genus Dennstaedtia is described from Brazilian and Peruvian Amazonia. Dennstaedtia aculeata (sp. nov.) is the third spiny species known for the genus, and the first in South America. It is compared with another Neotropical spiny Dennstaedtia, D. spinosa. We also present images, illustrations and a distribution map of the specimens, and discuss the habitat preference of the species towards nutrient-richer soils and spinescence in the family.

A extensa área coberta pelo domínio amazônico e os recursos financeiros limitados para estudos da biodiversidade exigem programas de pesquisa que obtenham o máximo de informação com os menores custos. Com o objetivo de avaliar as conseqüências da redução do esforço amostral sobre a retenção da informação ecológica, testou-se como diferentes larguras de parcela afetam os resultados da relação entre variação ambiental e composição da comunidade de pteridófitas da Amazônia Central. Foram feitas medidas da inclinação do terreno, abertura do dossel e do teor de argila do solo, em 37 parcelas de floresta de terra-firme. Todos os indivíduos de pteridófitas foram identificados e mapeados com relação a três faixas de amostragem. Foram testados os efeitos das variáveis ambientais sobre a composição de pteridófitas em parcelas de 250 x 2,5 m e em sub-amostras com a largura da parcela reduzida. A redução de 2,5 para 1 m na largura da parcela (60% de redução no esforço amostral) correspondeu a uma redução de 24% no custo do projeto, considerado os custos das excursões à campo, e a uma redução no número de espécies amostradas de 52 para 44. A redução 2,5 para 2 m na largura da parcela causou redução de apenas duas (4%) nas espécies amostradas e 8% no custo do projeto. Para todas as larguras testadas, a composição da comunidade esteve associada ao teor de argila e não esteve associada à inclinação do terreno. O efeito de abertura de dossel sobre a composição de espécies de pteridófitas não foi coerente entre os diferentes tamanhos de amostra. Esta incoerência deve estar relacionada à importância relativamente menor da luz sobre a estruturação da comunidade. Concluímos que as amostras com menor tamanho foram suficientemente informativas para detectar os principais gradientes de composição e sua associação aos fatores ambientais. Isso permitiria a redução nos custos totais ou alocação de mais parcelas pelo mesmo custo, o que poderia aumentar o poder dos testes estatísticos, reduzir o intervalo de confiança e aumentar a probabilidade de detecção de mais espécies.

The large area covered by the Amazonian domain and the limited financial support for biodiversity studies demand efficient research programs. Aiming to evaluate the consequences of reduced sampling effort on the retention of ecological information, we tested how differences in plot width affect the perceived relationship between environmental variation and the composition of the pteridophyte community in Central Amazonia. Measures of slope, canopy openness and soil clay content were taken in 37 terra-firme forest plots. All pteridophyte individuals were identified and mapped according to three sample strips. We tested the effects of environmental variables on pteridophyte composition of 250 x 2.5 meters-plots and on sub-samples of reduced width. The reduction of plot width from 2.5 to 1 m (60% reduction in sampling effort) corresponded to a reduction of 24% of the project's costs concerning field work expenses. This would reduce the number of sampled species from 52 to 44. The reduction of 20% plot width (from 2.5 to 2 m) would cause a reduction of two (4%) sampled species and a reduction of 8% of the costs. For all tested plot widths, community composition was associated with soil clay content and was not associated with the terrain slope. The effect of canopy openness on pteridophyte species composition was not consistent among sample sizes. These may be related to the relatively lower importance of light availability in determining community structure at the studied spatial scale. We concluded that the smallest plots were informative enough to detect the main gradients of composition and their association to environmental factors. This would allow a reduction in total costs, or the allocation of available budget to more plots, which could increase the power of the statistical analyses, reduce the confidence intervals and increase probability of detecting more species.